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(一)发病原因
小肠结肠炎耶尔森菌属肠杆菌科，有多种血清型和生物型分布在不同的来源。多数菌株为乳糖不发酵或低乳糖发酵，尿素酶阳性微需氧或兼性厌氧，在一般培养基37℃条件下生长缓慢，分离细菌的适宜温度为22℃。本菌耐寒冷，在低温水中可生存6个月，但对湿热及化学消毒剂敏感。
(二)发病机制
此菌可经口、鼻腔吸入下呼吸道，引起原发性肺炎，但大多数是先进入消化道，引起回肠末端小肠黏膜下淋巴组织集结溃疡形成，肠系膜腺体炎和门脉菌血症，细菌可通过全身进入肺内，尤其是肝硬化病人，易发生败血症。细菌毒力包括V、W膜抗原，温度敏感钙依赖性因子和内毒素，但此菌内毒素尚未发现有肠外毒性。结节性红斑和非化脓性多动脉炎可能是免疫复合物形成所致。