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PPMD常与角膜后营养不良的其他类型易相混淆,例如Fuch内皮营养不良、先天性遗传角膜营养不良和后无定型的角膜营养不良。后者通过灰白扩散的后基质的片状混浊,偶尔虹膜伸延到360°Schwalbe线以及各种虹膜异常,但是无青光眼。当角膜虹膜粘连出现,需同时考虑Axenfeld-Rieger综合征和ICE综合征,前二者中有许多较细的虹膜丝附于突出的Schwalbe环上。PPMD往往与先天性青光眼角膜后Haab’s线相混。尽管后者可以通过边缘的薄区域与之鉴别。内皮细胞显微结构在鉴别PPMD和其他有前角膜异常的疾病方面是有价值的。