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巧克力囊肿就是由于子宫膜移位而导致的，所以又称子宫膜移位。子宫内膜异位会随时间增加而变大，逐渐影响到正常组织，造成卵巢组织的严重损害。严重者甚至需要手术处理，并且也会影响到以后的生育功能，子宫内膜异位的发生主要有三种学说分别是种植学说、化生学说和上皮由来学说。而其中以种植学说最受推崇。
1.选择药物治疗时要根据患者年龄、症状等以及对生育有无要求做出适合的选择。主张选对药物积极治疗并结合密切随访复查，注意卵巢囊肿的性质变化，再采取相应的对策，要选择能符合患者的治疗方法。
2.手术治疗方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是本病最佳的处理方法。目前认为以腹腔镜确诊、手术+药物为内异症治疗的金标准。但要以医院是否有条件进行为基础，再决定是否做此手术而开腹手术可用于腹腔镜条件不具备或非常复杂的手术，如严重粘连和有多次手术史者。
3.由于其病因不清，其组织学发生复杂，不能完全预防。根据可能的病因及流行病学结果，可从以下几方面进行预防：防止经血逆流;药物避孕;防止医源性异位内膜种植。
4.检查时也要着重询问曾经的病史，并且进行妇科检查、.腹腔镜检查及其他辅助检以此来确定病情。
此病当发现痛经、性交疼痛或者不孕和月经失调等征兆时则需要立即就医，不能拖延，若是错过了最好的医治时间则有可能造成严重的后果，因此希望大家们都能多多注意自己的和家人们的身体健康，及时采取到有效的措施，为家人和朋友们带来一个好的未来。
