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脊索瘤是来自胚胎脊索的残余,退化的脊索通常都嵌入蝶骨和枕骨内,但部分可向腹侧折入咽壁,其与咽部上皮融合处的细胞有迅速增长的潜力,在某些诱因的作用下,如:放射线影响、毒性药物刺激尤其是对免疫功能有抑制作用的药物等影响,可形成脊索瘤,是一种罕见的低度恶性肿瘤。