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本病在急性发作后，可出现周期性发作的畏寒、寒战、高热等典型症状，需与疟疾和伤寒进行鉴别：
（1）疟疾如果发作不典型时，也可以在畏寒、寒战后发生高热，特别是间日疟，其发作也有周期性，故临床上如果怀疑这两个病的时候，可通过血液涂片查疟原虫，如果结果为阳性，则得以鉴别。若为阴性，而其它症状表现又不支持乙状窦血栓性静脉炎的情况下，可进行骨髓涂片。
（2）伤寒：伤寒的患者也可有类似的临床表现，此时可进行肥达实验，阳性者为伤寒。