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(一)发病原因
感染性ATIN主要见于急性肾盂肾炎，也可由血源性感染引起。最常见的病因是细菌，真菌、病毒和原虫感染。近来由于吸毒造成的HIV感染和在男性生殖器官的药物滥用而引起的感染性急性小管间质性肾炎也逐渐增多。感染性ATIN的病因主要有：
1.细菌 大肠埃希杆菌、副大肠杆菌、变形杆菌、分枝杆菌、葡萄球菌、克雷白杆菌、产气杆菌、产碱杆菌、铜绿假单胞菌、粪链球菌。
2.螺旋体 钩端螺旋体。
3.真菌 组织胞质菌。
4.立克次体。
5.病毒 巨细胞病毒、汉滩病毒、腺病毒、肠道病毒。
(二)发病机制
全身性感染所致的急性间质性肾炎，其发病机制可能不是细菌直接侵犯肾间质引起，而是细菌或其毒素对肾间质的免疫损伤。另一种可能是感染因子直接侵入肾间质引起，间质水肿和中性粒细胞炎性浸润，主要出现在肾髓质，而皮质炎症是反应性小管间质性肾炎的特点。急性肾盂肾炎引起的感染性ATIN，其间质损害呈局灶性，炎症病灶呈放射状分布，这与全身链球菌感染引起的反应性小管间质性肾炎的病理变化明显不同。在后者，浸润围绕血管呈环带状，主要集中在皮质和皮髓交界区。急性肾盂肾炎是细菌直接侵犯肾间质引起的急性化脓性炎症，又称急性化脓性间质性肾炎。常见的致病菌为大肠埃希杆菌，其次为副大肠杆菌、变形杆菌及铜绿假单胞菌。诱发感染的因素有尿路梗阻或其他尿路异常，妊娠、高龄、免疫力低下，尿道功能紊乱等。