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肥厚型梗阻性心肌病并没有明显的多发年龄段，从人的婴儿到老年的整个生命进程中都有可能会发病。目前，药物治疗是最为普遍的治疗方式之一，但对于部分情况较为严重的患者而言，尽早进行手术是十分必要的。一般来说，外科手术治疗肥厚型梗阻性心肌病的有效率可高达90%以上，大多数患者在术后能够取得非常好的疗效。
通常来说，肥厚型梗阻性心肌病手术需要全麻气管插管，切口通常选在正中胸骨处。除此之外，上下腔静脉与主动脉需要分别插管，以建立体外循环，等到患者的主动脉阻断后，即可根部灌注停跳液，开始手术。
手术过程中通常需要对患者的主动脉根部进行切开处理，由于患者通常会有间隔增厚的情况出现，需要在术中使用拉勾挡住主动脉瓣，这样才能更大程度地暴露手术部位。手术过程中，不仅需要仔细探查患者的二尖瓣乳头肌是否有畸形情况，还需要观察间隔肥厚的程度。
手术治疗肥厚型梗阻性心肌病大多采用扩大的室间隔肌肉切除术，通常从右冠瓣中点下方至左右冠瓣交界下方为手术切除范围。在操作过程中，如若患者同时存在二尖瓣结构异常的情况，还需要主刀医生及时处理，在切除操作结束以后，对主动脉切口进行周密缝合即可。在进行过肥厚型梗阻性心肌病手术七天后，还需再次进行复查，一般使用经胸超声即可判断手术效果。
对于肥厚型梗阻性心肌病患者而言，虽然有药物治疗、介入治疗等等方式可供使用，但目前医学界仍然认为外科治疗是最为有效，且最为根本的解决方法之一。但并不是所有的肥厚型梗阻性心肌病患者都适合进行手术，此类患者仍需要进行一系列的诊断检查，才能确定是否适合进行手术治疗。
