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人的身体经常会因为厌氧菌的感染而出现炎症，这时候医生会建议患者使用甲硝锉，所以这是一种用途很广的药物，不过需要提醒大家注意，大部分药物都会有一定的副作用，包括甲硝锉在内，甲硝锉可能会引起人体出现恶心呕吐以及食欲下降等症状；另外还有可能出现下列这些副作用。
【不良反应】15%～30%病例出现不良反应，以消化道反应最为常见，包括恶心、呕吐、食欲不振、腹部绞痛，一般不影响治疗；
神经系统症状有头痛、眩晕，偶有感觉异常、肢体麻木、共济失调、多发性神经炎等，
大剂量可致抽搐.少数病例发生荨麻疹、潮红、瘙痒、膀胱炎、排尿困难、口中金属味及白细胞减少等，均属可逆性，停药后自行恢复
【禁忌】有活动性中枢神经系统疾患和血液病者禁用
【注意事项】(1)对诊断的干扰：本品的代谢产物可使尿液呈深红色
(2)原有肝脏疾患者剂量应减少.出现运动失调或其他中枢神经系统症状时应停药.重复一个疗程之前，应做白细胞计数.
厌氧菌感染合并肾功能衰竭者，给药间隔时间应由8小时延长至12小时。
(3)本品可抑制酒精代谢，用药期间应戒酒，饮酒后可能出现腹痛、呕吐、头痛等症状。