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诊断急性肾炎时需除外以下疾病：
1.急性全身性感染发热疾病 于高热时均可出现一过性蛋白尿及镜下血尿，可能与肾血流增加、肾小球通透性增加及肾小管上皮细胞混浊肿胀有关。此种尿改变发生于感染、高热的极期;随着退热，尿检查恢复正常。不伴水肿、高血压等肾脏疾病的临床表现。
2.急性泌尿系感染或急性肾盂肾炎 急性肾炎时可有腰痛、少尿及尿中红细胞较多时，亦有排尿不适感，尿白细胞亦可较多，因此需与泌尿系感染相鉴别。但泌尿道感染性疾患有全身及局部感染的表现，如发热、尿路刺激症状、尿中大量白细胞甚至白细胞管型、尿细菌培养阳性。经抗感染治疗后的疗效亦有助于鉴别。
3.急进性肾炎 发病过程与本病很相似，但患者呈进行性少尿、无尿及急骤发展的肾功能衰竭，终至尿毒症。急性肾炎综合征1个月以上不见缓解时，需及时行肾活栓以与本病鉴别。
4.系膜毛细血管性肾炎 起病过程与本病很相似，也可有呼吸道前驱感染甚至链球菌感染史，约40%病人呈典型急性肾炎综合征表现并伴低补体血症，甚至血清ASO滴度亦可上升，临床过程很难鉴别。据1组20例临床诊断为本病的患者中有12例经病理检查证实为系膜毛细血管性肾炎。但系膜毛细血管性肾炎无自愈倾向，故诊断为本病者如病程超过2个月仍无减轻应考虑系膜毛细血管性肾炎，肾活检有助诊断。
