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造成血尿的疾病有很多种。大多数血尿与泌尿生殖系统疾病有关，常见的有泌尿系感染、结石、前列腺疾病、肿瘤、创伤等。多数血尿病人常伴有其他症状，例如急性膀胱炎、尿道炎等泌尿系统感染引起的血尿，常伴有尿频、尿急和尿痛等膀胱刺激症状；泌尿系结石导致的血尿，通常伴有急性腰部绞痛等。
少数病人在没有明显诱因的情况下突然出现肉眼血尿，但又没有疼痛等其他表现时，临床上称为“无痛性肉眼血尿”。无痛性肉眼血尿多见于老年患者，通常被视为泌尿系统肿瘤的重要警示信号，尤其要加以重视。其中膀胱癌是头号杀手，表现为排尿全程都有肉眼血尿，特别是当排尿到最后时，血尿会加重。
血尿表现不同，提示病变部位不同。血尿出现的时期可以反映病变的大致位置，初始血尿，为排尿开始时尿内有血，以后尿色逐渐变清，提示病变在尿道和膀胱颈；终末血尿，为排尿最后阶段才出现血尿，开始和中间阶段尿色清亮，提示病变在膀胱三角区、颈部和后尿道；全程血尿，从排尿开始至终止尿均为血色,表示病变在膀胱颈以上的部位。临床上还有尿道溢血，即血由尿道不自主地流出，与排尿无关，病变多在尿道括约肌远端。出现无痛性肉眼血尿的患者，必须详细讲述病史、接受仔细检查，尽早查明原因。
当然，并非所有的无痛性肉眼血尿都是由肿瘤引起的，患者不必恐慌，需要在医生帮助下具体分析原因。老年男性患者的前列腺增生也可以出现无痛性血尿，但常伴有排尿不畅、起夜多等下尿路梗阻症状；女性患者需要注意是否将阴道出血误认为血尿；血液系统疾病，如白血病、特发性血小板减少性紫癜等，引起全身凝血功能异常时，也可出现无痛性肉眼血尿；年轻人剧烈运动后可出现一过性无痛性肉眼血尿，休息一段时间就会消失，称为运动性血尿，属正常现象；一些长期服用阿司匹林、波立维等抗凝药物的患者出现血尿时，需要除外药物的影响，可以暂时停药或减量来观察病情变化；还要区分是否为假性血尿——虽然尿为红色，但经过显微镜检查尿中并没有红细胞，如果服用酚酞、利福平等药物，或者食用甜菜、色素类食品后，均可出现假性血尿。
除了了解详细的病史，辅助检查也有助于鉴别血尿的原因，常用的有尿常规和B超。