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输尿管结石的治疗方式比较多，但需根据患者的具体病情决定治疗的方式，比如患者结石的大小，生长的位置，以及数量的多少等，这些都是能够影响到治疗方式的方面，如果结石比较小，那么多数情况下都会选择保守治疗的方式，下面，就具体进行介绍：
1.输尿管肾镜取石和碎石术
输尿管肾镜可直接观察输尿管及肾盂内有否结石和狭窄，小结石可用取石钳或取石蓝直接取出，大的结石则用钞激光或气压弹道碎石予以击碎排出。用饮激光可同时切开输尿管狭窄环、祛除增生的肉芽使尿路通畅减少尿石复发。
2.经皮肾镜取石和碎石术
在B-USs或X光定位下将细针经腰部皮肤穿刺入肾盏，然后逐步扩张建立通道，将肾镜经通道置入旨盂肾盏进行取石或碎石。PCNL是一种先进的肾结石微创治疗方法，但仍有损伤、出血、感染等并发症。
3.开放手术
尿石症的传统治疗手段，取石效果确切，但由于创伤大、结石易复发等原因，现在大部分尿石症治疗已被微创方法所替代。但开放手术具有术中解除畸形、狭窄等复杂并发情况的能力目前仍然不可替代。
常用开放手术术式有：肾孟切开取石术、肾实质切开取石术、肾部分切除术、肾切除术、输尿管切开取石术等。
同时，在治疗过程中需要考虑是否雨哦感染的情况发生，如果有，为避免手术过程中引发感染，应该首先去除感染因素，之后在选择手术的治疗方式，如果是选择的保守治疗方式，那么只需要合并一定的杀菌药物即可。