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肾盂肾炎这种疾病的发病知识具有一定的特殊性，但是肾盂肾炎患者的疾病有效治疗是需要我们了解的知识有很多，随着我们对肾盂肾炎患者疾病认识程度的不断地加深，想要护理好肾盂肾炎的患者就需要知道疾病的一些发病机理。
如果尿路梗阻、畸形及机体免疫功能低下等易感因素持续存在，抗菌治疗未能彻底控制急性肾盂肾炎期形成的肾盂黏膜下的炎症或小脓疡，可留下小瘢痕，引起肾内梗阻，致使疾病反复发作及慢性迁延。
有人认为慢性肾盂肾炎的发病可能有自身免疫参与。有部分病人在急性肾盂肾炎期尿培养发现致病菌，而在以后的慢性进程中，尿培养却再没有致病菌出现，而疾病仍逐渐进入慢性肾盂肾炎。推测肾感染后，机体产生了抗大肠埃希杆菌的抗体，而肾组织与这些细菌有共同抗原性。
致病菌消失后，这种抗体继续与肾组织抗原发生免疫反应，从而引起肾损害。现已发现有一种肾小管抗原（TAMM-HORSFALL蛋白，称THP），与大肠埃希杆菌有共同的抗原性，抗大肠埃希杆菌的抗体可同时抗肾小管上皮细胞的THP，这可能与肾间质的慢性炎症发生有关。
其实对于肾盂肾炎患者的疾病治疗来说，我们最重要的还是护理好患者不要发生交叉感染，一旦出现疾病的交叉感染患者的疾病严重程度就会加深，再者肾盂肾炎患者的疾病有效治疗还需要我们的配合，这样才能缓解患者的症状。
