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常见白细胞增多和脓尿，但并非所有病人都有。大多数病人尿培养阳性，血培养阳性者占20%~40%。肾周脓肿在临床上与急性肾盂肾炎的不同之处是，前者在住院前已有较长时间的症状，且抗生素治疗开始后仍长期发热；肾周脓肿的症状一般持续5日以上，而急性肾盂肾炎一般短于5日。
超声检查通常可显示脓肿，但CT是最可靠的检查方法，几乎所有的肾周脓肿均可被CT测出。X线胸部检查约半数病人有异常，可见同侧肺炎，肺不张，胸腔积液或患侧横膈抬高。约有半数病人腹部平片也有异常，可见肿块，结石，腰大肌阴影消失和产气菌感染引起的肾周区肠外气体。排泄性尿路造影可见肾脏不显影或显影很差，肾盏变形，肾脏向前移位和单侧肾脏固定，X线透视或呼气/吸气期拍片显示的结果最清楚。