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弯曲菌感染的局部并发症是由该菌在胃肠道的直接播散所致，包括胆囊炎、胰腺炎、腹膜炎和胃肠道大量出血。空肠弯曲菌感染的肠外表现十分罕见，有脑炎、心内膜炎、脓毒性关节炎、骨髓炎和新生儿脓毒血症。不到1％的弯曲菌性肠炎患者可出现菌血症，最可能发生在免疫功能低下的患者、幼儿及老年人。免疫功能低下的空肠弯曲菌肠炎患者，常出现短暂性菌血症，但是由于大部分菌株被正常人体的防御机能迅速清除，以及急性胃肠炎患者不作常规的血液培养而常检测不到。空肠弯曲菌感染的病死率为0.05/1000。总体上来说，弯曲菌感染的并发症罕见，大多数不需要抗生素治疗。
弯曲菌感染后最严重的并发症为格林巴利综合症（GBS），是外周神经系统的急性脱髓鞘疾病，美国的年发病率为1～2/10万。某些弯曲菌血清型的感染并发GBS的危险较大，在美国，最常见的为Penner血清型O∶19；在南非，最常见的为Penner血清型O∶41。