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引起性病的病原体包括淋球菌、梅毒螺旋体、HIV(人类免疫缺陷病毒,human immunodeficiency virus)、肝炎病毒、支原体及衣原体等。女性直肠淋病可来源于自身泌尿生殖道,通过灌肠或肛温计感染或直接从阴道传播,但绝大多数直肠淋病由肛交感染。梅毒螺旋体、HIV、肝炎病毒所致胃肠道症状主要继发于性病本身。口肛接触者可互相传播沙门菌、志贺菌、肠道阿米巴病、链球菌或空肠弯曲菌等,引起消化道症状。