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阴道上皮内瘤样变可无症状或仅有阴道分泌物增多和(或)接触性阴道出血，体征上阴道黏膜可无异常或仅轻度糜烂。需注意的是，行妇科检查时，窥阴器需旋转，以便看清整个阴道黏膜，不然的话，在窥阴器叶片下的组织会被遗漏而漏诊。
阴道上皮内瘤样变无特殊的症状和体征，诊断主要靠：
1.阴道脱落细胞涂片检查是阴道上皮内肿瘤初步筛选的有效方法。凡是阴道细胞学涂片异常，应排除该异常细胞是否来自宫颈或外阴。
2.当阴道细胞学出现异常时，需行阴道镜检查。阴道镜下常可发现阴道上皮出现白色镶嵌状、点滴状和微粒状的表现。
3.凡阴道黏膜上有明显的病灶，可直接行活检送病理检查。如阴道黏膜无明显异常，可在阴道镜或碘液涂抹阳性处行活检送病理检查。
阴道上皮内瘤样变是通过病理来进行诊断，按其程度分为3级。
VAINⅠ：扁平上皮下l/3层细胞增生，轻度异型性，极性存在，核分裂象少见，中、上层细胞分化成熟。
VAINⅡ：扁平上皮下2/3层以内的细胞有中度异型性，极性稍紊乱，核分裂象多见，上1/3层内的细胞成熟。
VAINⅢ：扁平上皮下2/3层以上的细胞重度异型性，极性丧失，核分裂多，可见不典型核分裂，细胞边界不清。当发展到整个上皮层为不典型增生时则为原位癌。