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本病多幼年发病，但亦可初发于任何年龄。其皮损可分为三型：①扁平疣型：最为常见，皮损数较多且较大，单个皮损为米粒至黄豆大的扁平疣状丘疹，圆形或多角形，呈暗红、紫红或褐色，分布广泛，可累及大部分皮肤及黏膜。②花斑癣型：较少见，皮损为色素较淡的扁平丘疹，几乎不高出皮肤，轻微角化。③点状瘢痕型：最为少见，皮肤轻度凹陷，角化亦较轻微。皮损好发于面、颈、躯干、四肢，亦可泛发全身，甚至口唇、尿道口亦可发生小的疣状损害，躯干和四肢皮疹比较大而硬。可持续存在多年而无变化。约20%病人某些皮损可发展成鳞癌或基底细胞癌。此外，尚可伴掌跖角化、指甲改变、雀斑痣及智力发育迟缓。
根据全身泛发性扁平疣样损害的临床表现及病理检查可以诊断。为进一步确诊可作电镜检查及PCR检测。