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(一)发病原因
暗色丝孢霉病又称暗色孢子丝菌病(phaeosporotrichosis)、暗色真菌囊肿(phaeomycotic cyst)、脑着色真菌病(cerebral chromomycosis)等。暗色孢科真菌为条件致病菌，约有30余属50多种，其组织相均为棕色分隔的菌丝。当机体免疫力下降时，空气中孢子和菌丝可通过肺、皮肤伤口或其他途径感染人体，并可经血液循环播散至全身。暗色丝孢霉病较少见，可分为两类：皮下组织暗色丝孢霉病和系统性暗色丝孢霉病。皮下组织暗色丝孢霉病常表现为孤立的皮下或肌肉脓肿，也可表现为皮下囊肿，称为暗色真菌囊肿。若血行播散，以肺脏、骨骼、心内膜及脑最易累及，肝、脾、肾等也常受累，出现化脓性肉芽肿样反应伴脓肿形成，多预后不良，一般在发病1年内死亡。
(二)发病机制
本病可由裴氏、紧密、疣状、皮炎着色真菌及分支孢子菌等引起。国内以卡氏枝孢霉为最多见，其次为裴氏着色菌、紧密着色真菌、甄氏瓶霉等。最近又发现棘状外瓶霉等暗色丝孢霉所引起者。暗色孢科真菌为条件致病菌，约有30余属50多种，其组织相均为棕色分隔的菌丝。在组织或脓液中呈圆形棕黄色真菌细胞，直径6～12μm，并不生芽，在自然界分布很广，多寄生在潮湿的土壤与腐烂的谷草木材中，当机体免疫力下降时，空气中孢子和菌丝可通过肺、皮肤伤口或其他途径感染人体，并可经血液循环播散至全身。偶可侵犯脑组织及其它脏器。