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在临床上急性肺脓肿一般首选的抗菌药是抗生素。在大多数情况下，抗生素最初是通过静脉给药的，当患者病情好转且症状缓解后可改为口服给药。直到症状完全消失且胸部X光片显示脓肿已经清除，才可停止使用抗生素治疗。对于特殊病原体引起的肺脓肿，应根据病原体的种类不同给予不同的抗生素。
1、混合性感染
首选青霉素，还可选用或联合应用其他抗厌氧菌感染治疗，如林可霉素、克林霉素、甲硝唑等。
2、金黄色葡萄球菌感染
金黄色葡萄球菌感染的肺脓肿，可选用耐青霉素酶的半合成青霉素，如苯唑西林钠或者是头孢唑林、头孢克洛、头孢呋辛等头孢菌素。如果是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌则应该首选万古霉素、利奈唑胺等药物。
3、革兰阴性杆菌感染
革兰阴性杆菌感染常用第二、三代头孢菌素，如头孢曲松、头孢他啶等。
4、阿米巴原虫感染
阿米巴原虫感染可用甲硝唑。
在使用抗生素之前，患者需要采取血、痰等标本送检，做病原菌培养及药物敏感性试验。根据所检查出来的情况，才能选择适合患者的抗生素。抗生素都是有一定的副作用的，患者一定要谨慎使用。
通过上述的介绍，可以知道急性肺脓肿一般首选抗生素来作为抗菌药物。患者的病原体不同，所使用的抗生素也不一样，患者可以在医生的指导下使用。如果抗生素效果显著，建议患者最好是做经皮肺穿刺引流。只有将肺部的脓液排出来，才能使肺脓肿恢复、除必要的治疗外，患者平时也要做好口腔护理，勤刷牙，尽量避免引发全身免疫力以及起到防御清楚功能降低的诱因。
