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艾滋病有许多它特有的疾病特征，这些特征在给病人带来痛苦的同时，也加深了人们对于这种疾病的恐惧。在免疫学上，艾滋病的特征总结为就是艾滋病毒侵害到人体之后，破坏人体本身的免疫细胞，最红损害人体的整个免疫系统。
当激活免疫反应的t4细胞几乎全部被HIV消除，t4细胞抑制细胞在数量上巨增，相反病人体内t4细胞在数量上骤减，从而导致病人的免疫功能全部衰竭，为条件性感染创造了极为有利的条件。
HIV对神经细胞有亲合力，能侵犯神经系统，引起脑组织的破坏，或者继发条件性感染而致各种中枢神经系统的病变。HIV和其它逆转录病毒一样，当逆转录酶使病毒的RNA作为模板合成DNA而成前病毒DNA整合到宿主细胞的DNA中时，HIV带有的致癌基因可使细胞发生癌性转化，特别是在细胞免疫遭到破坏，丧失免疫监视作用的情况下，细胞癌变更易发生。
HIV有10%碱基序列不同。是单链RNA病毒，外有核壳蛋白，此外还有一种特殊的逆转录酶，能以单链RNA作为模块，转录为双链DNA，该双链DNA可与宿主细胞的DNA结合然后逆转录为病毒的单链DNA，因此感染艾滋病病毒后，病毒的核酸永远与宿主细胞结合在一起，使得感染不能消失，机体无法清除病毒。现已证实HIV是嗜t4淋巴细胞和嗜神经细胞的病毒。HIV由皮肤破口或粘膜进入人体血液，主要攻击和破坏的靶细胞t4淋巴细胞(t4淋巴细胞在细胞免疫系统中起着中心调节作用，它能促进B细胞产生抗体)，便得t4细胞失去原有的正常免疫功能。
艾滋病的本质是一种超级肿瘤，但是它不能跟其他肿瘤一样，采取“切除”手术，主要是因为它作用的是人的整个免疫系统，人们根本无从下手。
