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1.对症治疗
有高热剧痛者予以解热、镇痛处理。有明显溶血者,可予输血。注意休息、饮食。
2.药物治疗
药物治疗首选克林霉素,20mg/(kg?d),肌内注射7~10天。对早产婴儿接受输血而感染微小巴贝虫者,可加用奎宁,25mg /(kg?d),口服7~10天。应用万古霉素治疗,成人剂量每日500mg-2g,日服3~4次,连服7-10天。对已摘除脾脏的成人患者,可用克林霉素60mg/(kg?d)肌内注射7天,同时口服奎宁650mg,3次/d连服7天。单用克林霉素肌内注射或与奎宁口服配伍使用,是近年来用于治疗微小巴贝虫所致人巴贝虫病的安全有效药物,两药配伍使用既能迅速退热,又能减少原虫血症。硫酸奎宁与氯喹配伍使用,亦有疗效。