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本病临床表现复杂，须与伴有发热、关节炎、睾丸炎、脑膜炎及肝脾肿大等多种疾病相鉴别，常见的有以下几种。
1.肺结核 活动性浸润型肺结核、干酪性肺炎与急性粟粒型肺结核，都可引起急性发热与肺部病变，但局限性症状如关节痛和神经痛不著，痰中可找到结核杆菌，结核菌素试验阳性，抗结核药物治疗有效。
2.伤寒、副伤寒 稽留热、玫瑰疹、出汗不著，肥达氏试验阳性，血培养分离为伤寒或副伤寒杆菌。
3.疟疾 发热急剧，周期性寒战，发热反复发作，脾大明显，血液或骨髓涂片可找到疟原虫。
4.风湿热 白细胞增多，血沉明显增快，心脏瓣膜及心肌病变，环形红斑，抗链球菌溶血素“O”增高，对水杨酸制剂的疗效好。
5.亚急性细菌性心内膜炎 通常发生在器质性心脏病的基础上，新近出现的心脏杂音并有强度与质的改变，皮肤瘀点，栓塞现象，血培养阳性。
6.其他 应与类风湿关节炎、流行性感冒、败血症、兔热病、钩端螺旋体病、淋巴肉芽肿、病毒性肝炎、肝包虫病、黑热病、结核性睾丸炎、系统性红斑狼疮等相鉴别。