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发现肛门闭锁的主要办法就是仔细观察阴部，如果没有发现正常肛门，就是无肛门，就可以判别为肛门闭锁疾病。还有就是排便问题，在正常情况下，婴儿出生后24小时内会有大便的排放，如果是肛门闭锁患儿，就没有大便的排放。还有就是婴儿发生腹胀，随时间的延长，腹胀越明显。还有就是婴儿经常性的呕吐，如果患儿是闭锁肛门，自然就排放不出消化的食物，导致患儿经常性的呕吐。如果患儿出现以上情况，可以考虑是肛门闭锁。
肛门闭锁一般在孩子出生临床上发生，绝大部分孩子都是在新生儿期发现的，这种疾病给医务人员和家长极大的困扰，所以孩子出生以后，不管是医生 、护士还是家长都要密切的接触孩子，每个部位都要进行仔细的观察，首先就是看孩子排便的情况，如果孩子出生后一天 两天或者三天没进行排便，就要及时的检查肛门的情况。如果发现肛门有闭锁的情况，那么就及时到专科医院，找专科医生来做进一步的检查，来看患儿是哪一种类型闭锁疾病，下一步需要采取什么措施，都要听专科医生的安排。
一般情况下可以进行肛门视诊，让患者侧卧位，医生用双手将患者臀部掰开，首先从外面检查肛门周围有无肛口，有无内痔、息肉脱出、直肠脱出、外痔及瘘管外口等。观察内痔位置、数目、大小以及色泽，还有无出血点，同时也可以仔细的观察看到有无肛裂等情况。
还可以进行指肠检查，医生把润滑剂涂在食指上，把食指轻轻插入患儿的肛门，可以发现肛管和直肠下端有无异常改变，如皮肤变硬、波动感、硬结、狭窄等情况，多见于肛门直肠周围脓肿，触到柔软、光滑、活动、带蒂的弹性包块，多为直肠息肉，若摸到凹凸不平结块，质硬底宽，与下层组织粘连，推之不动，拉出手指时，手套上有褐色血液粘附者，应考虑为直肠癌，若手指插入引起肛门剧烈疼痛，可能为肛裂，不应再勉强插入。
总之而言为了婴儿的健康正常成长，医务人员或者家长应该在婴儿出生时期多观察婴儿的每个部位，最重要的是排便问题，如果发现是肛门闭锁，应及时到专科医院进行治疗。孩子是父母的一生，也是全家人的希望，各位家长应该多观察孩子的每一个部位，减少孩子的痛苦，自然早期治疗比晚期好的多，如发现孩子有异常，应及时到专科医院进行治疗，减少后期出现的各种疾病。
