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肌肉萎缩和肌营养不良的区别主要在于肌肉萎缩导致的肌肉功能障碍可以通过恢复神经功能得到治愈，而肌营养不良则难以痊愈。
肌肉萎缩主要是指横纹肌营养不良，是由于肌肉本身的疾病或神经系统功能的功能障碍而导致的疾病症状。患者各个部位的肌肉都在不断发育，如果因病导致肌肉的发育受阻，那么就会引起肌肉萎缩。而肌营养不良则是一种进行性肌无力，属于遗传性疾病，大多发生在儿童身上。如果新生儿确诊该病，其步行年龄将会推迟，走路特别慢，而且会很容易摔倒。随着疾病的发展，儿童的病情会加重，对儿童的生长发育有所不利。
这两者最大的区别是肌肉萎缩可以通过患者的积极锻炼逐渐好转，而肌营养不良则难以好转。如果是因骨折导致肢体制动时间长，从而引起的肌肉萎缩，一般等骨折痊愈后进行积极的锻炼是可以恢复的。而肌营养不良，再怎么积极锻炼也不一定能恢复肌肉功能，肌肉甚至会随肌营养不良的加重而进行性缩小，最终导致肌肉或肢体完全不能活动，或者活动功能非常差。
