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1.肾、膀胱阿米巴病 可出现肾区钝痛、畏寒、发热、尿频、尿急、尿痛等症状，肾区持续性钝痛或剧痛，伴发腰肌紧张和强直。可出现米汤样尿或果酱样尿，有时还可出现烂鱼肠样腐败组织，是阿米巴膀胱炎特征症状。
2.阴茎阿米巴病 阴茎皮肤表面可出现不规则的表浅溃疡，边缘隆起，表面覆以血性或脓性分泌物。
对有典型阿米巴感染史伴有泌尿生殖系统症状者，应高度怀疑本病，实验室及血清学检查为确定诊断的重要依据。