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一般情况下，疾病在潜伏期无发病症状或是症状较轻容易被患者忽略，而生殖器疱疹是一种严重的性传播疾病，在潜伏期患者身体也是会有异常表现的，所以应该多加注意发病症状。
生殖器疱疹的潜伏期是很长的，生殖器疱疹HSV感染后平均约4～5日，外阴患部先有灼热感，旋即发生成群丘疹，可为一簇或多簇，继之 形成水疱。数日后演变为脓疱，破溃后形成糜烂或浅溃疡，自觉疼痛，最后结痂自愈，病程约2周。皮损多发于男性的包皮、龟头、冠状沟 和阴茎等处，偶见于尿道口。
大概说来，生殖器疱疹的潜伏期症状：
1、生殖器疱疹潜伏期表现有破溃后形成糜烂、溃疡、结痂，伴有疼痛。
2、皮损单发男性生殖器疱疹潜伏期症状好发于龟头、冠状沟、阴茎体或尿道口。
3、女性生殖器疱疹潜伏期症状多在阴唇、肛周或阴道发疹，约90%同时侵犯子宫颈，也可累及直肠粘膜。
4、生殖器疱疹潜伏期表现常伴有发热、头痛、乏力、肌痛、腹股沟淋巴结肿大和压痛。症状持续1-2周，一般3-4周皮损结痂、愈合。或 融合
5、大腿或臀部瘙痒或灼痒、疼痛。继而，阴部、臀部、肛门或身体的其他部位会明显的溃疡。
患者切不可将以上发病症状盲目认为一般的感染，也不可私自到药店买药治疗，只有经过科学的检查方法确诊病情发展情况，才能根据医生的建议药物治疗，严重者应该采取其他治疗方式。