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预防：主要是治好血吸虫病人，消灭传染源。加强粪便管理，消灭钉螺、椎实螺和尾蚴;加强个人防护等几个环节。卫生部于2003年制定了《血吸虫病重大疫情应急处理预案(试行)》，对重疫区血吸虫病急性感染的疫情实行周报告和零报告。应急预案要求，在发生血吸虫病暴发流行和重大突发病情时，疫情发生地可根据疫情趋势和控制暴发流行的需要，成立疫情应急处理工作领导小组;卫生行政部门(血防部门)应成立血防、卫生监督和其他相关医疗机构参加的疫情应急处理技术指导小组。当发现急性血吸虫病暴发流行或在既往无疫情地区发现首例当地感染的确诊病例时，执行职务的血防、医疗保健、卫生防疫人员应以最快的速度向当地血防(疾病控制)机构报告，后者向上级部门报告。在血吸虫感染高峰期的6～10月份，建立急性病人暴发天报制和散发病人周报制。
根据洪水涨退与血吸虫病感染高峰季节，防治可分为3个时期：①洪水汛期前期。在洞庭湖洪水上涨前3月底至5月份，对垸内和垸外易感地带开展认真查螺，掌握感染性钉螺分布地带，并进行药物杀灭处理。②汛期和洪涝灾害期。洞庭湖洪水开始上涨时，也正是血吸虫感染高峰期，应对垸外易感地带进行水体灭蚴;对接触疫水人员，特别是防汛抢险的军民和溃垸后临时居住在防洪大堤上的灾民，进行逐一登记造册，以便及时给予早期治疗;对高危人群施以人体防护。③退水期。对接触疫水者，开展追访，进行早期治疗。垸外易感地带洪水下退至有螺线时，及时灭蚴。开展查螺和查病，掌握灾后疫情，同时开展人、畜化疗。
防治措施包括以下几方面：
1.灭螺灭蚴 是切断流行环节的重要措施，可结合施肥、喷洒农药来进行灭螺灭蚴。
(1)氨水：灭螺灭蚴效果好，肥效高。每亩施10～15kg即可杀死90%的螺，但药效仅能维护6h。
(2)碳酸氢铵：遇水很快分解释放出氨，每亩施15kg。
(3)五氯酚钠：每亩施0.5kg，药效可维持5天，灭螺效果也好。该药有毒性，应加强防护。
(4)氯硝柳胺：灭钉螺效果好。
(5)草木灰：每亩50kg，可灭螺。
(6)茶子饼：每亩15～25kg，其中所含皂碱有灭螺作用。