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血清AFP的测定含有连接于糖链的天冬酰胺的血清AFP是恶性肿瘤特别是肝细胞癌和内胚窦瘤的最可靠的肿瘤标记物。研究发现由不同肿瘤产生的AFP由于其糖链结构的不同可采用Lectin亲和电泳法分成不同的异构体。试剂包括conA、LCA、E-PHA及alloA，血清的AFP通过ConA被分成两部分，即conA未反应型(C1)和conA反应型(C2)。子宫肝样腺癌、阴道内胚窦瘤和卵巢内胚窦瘤皆可检出C1和C2，而脐血中仅测出少量的C1。通过LCA被分成3部分，即L1、L2和L3。阴道内胚窦瘤含有L2和L3，这4种组织来源的AFP的异构体均不同。通过E-PHA可测出P2、P3、P4、P5和一个亚型P3f，而阴道内胚窦瘤表现为P2、P3f、P4和P5。其异构体谱与卵巢内胚窦瘤明显不同。通过alloA可检测出两个主要部分，即A1和A3及一个亚型A1s，阴道内胚窦瘤表现为A3、A1及A1s，其表现明显不同于其他来源的AFP。因此，可通过Lectin亲和电泳检测血清AFP的异构体谱确定AFP的来源部位。测定血清AFP可以评定治疗效果及监测治疗后的复发。
1.B超检查可显示阴道内肿块的大小、形状等，但阳性率不高。Handel报道的3例中有2例B超检查阴性。
2.CT检查可显示阴道有占位病变及膀胱、直肠、淋巴结或远处器官是否有转移。
3.MRI检查MRI提供的图像比CT和B超更精确、全面。它可更好地显示肿瘤的位置、大小及范围。能够准确地显示肿瘤的边缘，它的无损伤及无电离放射性，尤其适合于婴幼儿的盆腔检查。软组织的对比性优于CT检查。
4.膀胱镜检查可以显示膀胱及尿道是否被肿瘤侵犯。
5.阴道镜检查无论影像学检查结果是否阳性，对于婴幼儿无明原因的阴道流血，应行阴道镜检查。可见起源于阴道壁的外生性、质脆肿物。行阴道检查及阴道镜检查时发现肿物应行组织活检。