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(一)脑脊液常规检查70%的患者脑脊液压力增加，一般为1.96～3.92kPa(200～400mmH2O)，慢性病例可在正常范围内，外观清澈、透明或微混。97%病例的白细胞计数轻至中度增多，平均约180/mm3，少数可超过500/mm3，常以淋巴细胞占优势。90%以上病例的蛋白含量呈轻至中度增高，个别可达400mg/dl以上。糖定量大多减低，少数病例可降至0。氯化物含量轻至中度减低。艾滋病人合并隐球菌脑膜炎时，脑脊液检查可正常，但病原检查阳性！
(二)病原检查
1.涂片早期脑膜炎脑脊液涂片阳性率可达85%以上，取3～5ml脑脊液，离心沉淀，沉淀物加等量上海墨汁，显微镜下检查。菌体直径4～6μm，外圈有一透光厚壁，厚度一般为5～7μm，厚膜是致病性隐球菌的标志。以10%氢氧化钾液处理或直接涂片作镜检，则只见菌体而不见厚膜，常误认为淋巴细胞。
2.培养将标本接种于葡萄糖蛋白胨琼脂培养基上，室温(25℃)或37℃培养2～5日即可生长。非致病性隐球菌在37℃时不生长。培养无生长时需保留3～4周。痰培养阳性率仅20%，脑膜炎病人脑脊液培养阳性率较高。
3.动物接种以小白鼠最敏感，将脑脊液或其他标本行腹腔内、尾静脉或颅内注射，小白鼠在2～8周内死亡，脑内可发现大量隐球菌。
(三)免疫学试验
1.抗体检测隐球菌的厚荚膜内含特异抗原性的多糖体，约90%隐球菌脑膜炎患者的血清或脑脊液中可检出这一抗原或相应抗体。
2.抗原检测以隐球菌抗体包被乳胶，则可用来检测抗原。脑膜炎病人脑脊液抗原的阳性率达92%，血清的阳性率为75%。而非脑膜炎病人的阳性率为20%～50%。患者体内若存在类风湿因子，则可出现假阳性，须设立类风湿因子阳性对照。脑脊液含抗原而无抗体者提示病变仍在活动，反之则说明病情在好转中。脑脊液涂片阴性患者的抗原检测可为阳性。
X线摄片：疑为肺隐球菌病应做X检查(图3)。肺隐球菌病X线检查无特异性，可见有弥漫性炎性浸润、支气管周围浸润或类似粟粒结核阴影。肺门及纵隔很少被侵犯。
骨累及时，X线检查示边缘清楚的溶骨性损害。
