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1.干酪性肺炎 急性结核性肺炎临床表现与肺炎链球菌肺炎相似，X线亦有肺实变，但结核病常有低热乏力，痰中容易找到结核菌。X线显示病变多在肺尖或锁骨上下，密度不均，病久不消散，且可形成空洞和肺内播散。而肺炎链球菌肺炎经青霉素治疗3～5天，体温多能恢复正常，肺内炎症也较快吸收。
2.其他病原体引起的肺炎 葡萄球菌肺炎和克雷白杆菌肺炎的临床表现均较严重。革兰阴性杆菌肺炎常见于体弱、心肺慢性疾病或免疫受损患者，多为院内继发感染。痰液、血或胸液细菌阳性培养是诊断不可缺少的依据。病毒和支原体肺炎一般病情较轻，白细胞常无明显增加，临床过程、痰液病原体分离和血液免疫学试验对诊断有重要意义。
3.急性肺脓肿 早期临床表现与肺炎链球菌肺炎相似。但随着病程的发展，出现大量特征性的脓臭痰。致病菌有金黄色葡萄球菌、克雷白杆菌及其他革兰阴性杆菌和厌氧菌等。X线显示脓腔和液平，较易鉴别。
4.肺癌 少数周围型肺癌X线影像颇似肺部炎症。但一般不发热或仅有低热，周围血白细胞计数不高，痰中找到癌细胞可以确诊。中央性肺癌可伴阻塞性肺炎，经抗生素治疗后炎症消退，肿瘤阴影渐趋明显，或者伴发肺门淋巴结肿大、肺不张。对于有效抗生素治疗下炎症久不消散，或者消散后又复出现者，尤其在年龄较大者，要注意分析，必要时做CT、痰脱落细胞和纤支镜检查等，以确定诊断。
5.其他疾病 肺炎伴有胸痛时，需与渗出性胸膜炎、肺梗死鉴别。胸腔积液体征和X线有其特征。肺梗死有静脉血栓形成的基础，咯血较多见，很少出现口角疱疹。下叶肺炎有时出现腹部症状，应以X线和其他检查与膈下脓肿、胆囊炎、胰腺炎等鉴别。