宫颈光滑但有宫颈囊肿是否严重，取决于宫颈囊肿的病因，如果是生理性变化，通常并不严重，如果是病理性变化，可能是比较严重的。应尽早就医，根据诊断结果，遵医嘱选择合适的治疗措施。
鳞状上皮取代柱状上皮的过程中，新生的鳞状上皮覆盖子宫颈腺管口或伸入腺管，腺管口堵塞后会影响腺体分泌物的引流，潴留在局部会形成囊肿。属于宫颈化生的产物，是一种正常的生理变化，没有明显的不适症状，通常并不严重。
子宫颈局部损伤或宫颈的慢性炎症，会导致腺管口狭窄，容易刺激宫颈囊肿的形成。可能会导致宫颈肥大、硬度增加和弹性降低，还有可能会出现分泌物异常的表现，如果不积极采取措施进行治疗，囊肿增大后可能会对膀胱和直肠造成压迫，容易引起排尿不畅和排便困难，会影响正常生活，可能是比较严重的，通常需要采取宫腔镜下电切术或宫颈腺囊肿造口术的方式治疗。
在平时的生活中需要养成良好的卫生习惯，多注意性卫生，过性生活的时候可以使用避孕套，有助于降低病原体感染的几率。