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肛瘘疾病是很常见的肛肠疾病之一，并且，一定要知道的一点是，肛瘘这种疾病很多情况下都是感染而引起，因此说，卫生方面是一个重点，最常见的情况就是肛门部位的卫生问题，尤其是在夏季，下面就肛瘘的病因进行介绍：
1.肛门周围脓肿：主要因污感、粪便滞留肛隐窝，引起肛腺炎，导致肛门周围脓肿，是肛瘘形成的主要原因。
2.直肠肛门损伤：外伤、来自消化道的滑性异物、金属、肛表及肛门窥器检查损伤肛管直肠，细菌侵入伤口即可引起肛门周围脓肿。
3.瘘道多在肛门括约肌之间通过，由于括约肌经常不断地收缩与舒张，压近瘘道。影响脓液的排出。容易贮脓感染而难于愈合。
4.肛门直肠周围脓肿破溃后，脓液排出，脓腔逐渐缩小，外部破溃口和伤口也缩小，腔壁形成结缔组织增生的坚硬管道壁，因而不能自然闭合。
5.肛门静脉回流不畅，局部经常淤血，组织营养不良，影响愈合。
6.结核杆菌、放线菌等感染所形成的脓肿，克隆氏病等难以自愈而形成特殊性肛瘘。
另外需要注意的一点是，肛瘘疾病虽说主要是因为感染而引起，但这并非是绝对的，也有其他方面的病因，比如邻近器官炎症的蔓延就可以引起肛瘘的发病，这样的病情也是最复杂的，治疗疾病需要参考多个方面。