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多数表现为自发性肾动脉粥样栓塞的病人有氮质血症和表现为缓慢进行性肾衰。而那些在血管操作后动脉粥样血栓形成者可发生急性少尿性肾衰。肾衰病人通常无肾脏相关的症状，尽管血管紧张素Ⅱ介导的高血压可在一些病例中发生。尿液分析常为良性的微量蛋白尿，然而偶尔出现肾病范围蛋白尿。在急性期可出现嗜酸细胞增多，嗜酸细胞尿和暂时性的低补体血症。
栓塞常常影响其他腹部器官（如胰腺，胃肠道）。分布广泛的外周栓塞的体征（如网状青斑，痛性肌肉小结，明显的坏疽）强烈提示诊断，但不常常出现。视网膜栓塞形成可导致突然失明。在眼底镜检查时可见视网膜小动脉中的橙黄斑。