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始基囊肿的主要检查方法是病理检查，顾名思义，就是检查口腔囊肿的病理改变，目的是为了研究始基发生囊肿的病变过程，检查他们的病变，探讨病变产生的原因、发病机理、病变的发生发展过程，最后做出病理诊断。这种方法主要是病理形态学的检查方法，首先观察口腔牙齿始基囊肿的病理改变，然后切取一定大小的口腔病变组织，用病理组织学方法制成病理切片，用显微镜进一步检查病变。
主要的检查方法有以下：
1、脱落细胞学检查 通过分泌物涂片来检查囊肿的情况，能够诊断出属于阳性还是阴性、。
2、流式细胞术 流式细胞术是近年来发展起来的一种快速定量分析细胞的新技术，目前已广泛用于肿瘤研究，对于检查始基囊肿有很重要的意义。
3、图像分析技术 病理形态学的观察基本上是定性的，缺乏精确而更为客观的定量标准。图像分析技术的出现弥补了这个缺点。随着电子计算机技术的发展，形态定量技术已从二维空间向三维空间发展。在肿瘤病理方面图像分析主要应用于核形态参数的测定(区别癌前病变和癌;区别肿瘤的良恶性;肿瘤的组织病理分级及判断预后等)，DNA倍体的测定，显色反应(如免疫组织化学)的定量等方面。
4、活体组织检查 从患者身体的病变部位取出小块组织(根据不同情况可采用钳取、切除或穿刺吸取等方法)或手术切除标本制成病理切片，观察细胞和组织的形态结构变化，以确定病变性质，作出病理诊断，称为活体组织检查，简称活体。这是诊断肿瘤常用的而且较为准确的方法。近年来由于各种内窥镜(如纤维胃镜、纤维结肠镜、纤维支气管镜等)和影像诊断技术的不断改进，不但可以直接观察某些内肿瘤的外观形态，还可在其指引下准确地取材，进一步提高了早期诊断的阳性率。
以上就是关于始基囊肿的检查方法，通过这样的检查方法得出来的检查结果，进一步可以分析他们的病理，而且在这样的检查结果可以做出更好的诊断，在这样的环节中，是具有重要意义的，而且检查是为了更好地做出诊断，而诊断是为了更好地治疗，这是我们在熟悉不过的事。希望以上始基囊肿的检查方法对大家有所帮助。