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传统的治疗措施是抗生素与手术引流相结合。最近单用抗生素已成功地治愈了肾皮质脓肿（特别是金黄色葡萄球菌引起的）。被推荐用于金黄色葡萄球菌感染的抗生素有新青霉素Ⅱ和新青霉素Ⅲ，100～200mg/kg，静脉注射，每4小时1次。万古霉素，每次1g静脉注射，每12小时一次。先锋霉素Ⅴ，每次2g，静脉注射，每8小时1次。上述抗生素可轮换使用，静脉注射连续10～14天，然后改为口服，连续14～28天。如果治疗48小时后，病情无好转，再应考虑为耐药菌株感染或合并有其他疾病，如肾周脓肿。此时需在超声或CT引导下经皮肤脓肿穿刺引流，如果引流后病情仍无明显改善，则需进行外科手术。