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1.腹痛 最常见，约占62%。疼痛位于中上腹或左上腹，多为反复发作的持续性疼痛，少数为钝痛，可放射至背、肩、左肋缘，与进食有一定关系。其严重程度、发作间隔和持续时间差异较大，有些病人疼痛剧烈，发作频繁，影响工作和生活，有些病人仅偶有上腹部不适感。疼痛是由于结石阻塞胰管使胰液不能排出，胰管压力增高，或为Oddi括约肌水肿痉挛所致。在并发慢性胰腺炎时，炎症刺激神经末梢也是疼痛原因之一。
2.脂肪泻和营养不良 由于胰石阻塞胰管，加上胰腺组织破坏，导致胰腺外分泌功能不足。轻者可表现为大便次数、大便量增多，重者可见大便表面有油状物。长期的脂肪泻可使营养物质吸收障碍，导致营养不良和消瘦。外分泌功能障碍的程度与病因、结石位置和结石分布范围有关，酗酒和结石分布于胰头体部或全胰者损害发生率较高、程度较重，结石分布于胰尾部者损害较少、较轻。
3.黄疸 胰结石阻塞于壶腹部，或胰头慢性炎性肿块压迫胆总管下端，或Oddi括约肌水肿痉挛，均可引起黄疸。
4.糖尿病 显性糖尿病占32%，糖耐量异常占68%。是由于胰岛细胞破坏，胰岛素分泌量减少所致，也有人认为是胰岛素、胰高糖素和生长激素分泌均减少所致。此种糖尿病较难用药物控制。
5.腹部体征 不明显，偶有中上腹或左上腹轻压痛，无反跳痛。在并发假性囊肿形成时，可扪及腹部囊性肿块。
根据临床表现，辅以影像检查，一般均可作出明确的诊断。尤其是影像检查对胰石病的诊断率非常高。目前以B超和腹平片为首选方法，需要时选用CT、MRI和ERCP检查。