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喉淀粉样变须与喉部良、恶性肿瘤和喉返神经麻痹鉴别。二者均有声音嘶哑症状，但与本病鉴别并不困难。喉部肿瘤可经活检病理组织学证实。喉返神经麻痹则无局部黏膜肥厚或息肉样改变，间接喉镜和纤维喉镜可见一侧声带麻痹，不能闭合。胸片可显示纵隔淋巴结肿大，导致喉返神经受压，多因肺癌淋巴结转移所致。
气管支气管淀粉样变应与支气管结核及肿瘤鉴别。支气管结核常伴肺结核，多有刺激性咳嗽、发热、盗汗等结核中毒症状，支气管镜下可见黏膜充血、干酪样坏死或溃疡形成，与本病黏膜完整苍白完全不同。刷检或灌洗液中可查到抗酸杆菌。支气管癌病情进展快，较早出现阻塞症状，支气管镜下黏膜肿块明显，可伴上皮损伤、出血、糜烂或呈菜花样，可覆白苔样坏死物。以上表现可资与本病鉴别。最后诊断有赖于病理组织学检查结果。
肺结节型淀粉样变应与肺良、恶性肿瘤或转移癌鉴别。肺弥漫性粟粒型或肺泡隔型淀粉样变则与肺间质纤维化、结节病、过敏性肺泡炎等弥漫性间质病及含铁血黄素沉积症、肺泡微结石症等沉积性疾病鉴别。对此需采用各种必要的活检手段，积极获取标本，经病理学检查明确诊断。