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青霉菌病需和曲霉病相鉴别。在组织内,青霉菌表现为分支分隔的菌丝,与曲霉相似,若在组织内发现曲霉菌分生孢子头或青霉菌帚状支,则可明显区别。取活组织进行分离培养在鉴别诊断上有重要意义。相对别的病症应该加以区别,变态反应性曲霉病会有畏寒、发热、乏力、刺激性咳嗽,伴明显哮喘。咯棕黄色脓痰,有时带血。病变部位可闻干、湿啰音等病症。