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高位肛瘘和低位肛瘘是两种完全不同的肛肠疾病，要想正确区分需要从病灶入手，一般情况下约肌深部以上为高位，以下为低位，所以治疗方法也不相同，但是两者之间的相同之处却有很多，主要表现为排脓、疼痛、瘙痒、硬结或瘢痕等，另外还有全身症状，比如消瘦、贫血、便秘等。
一、肛瘘高位和低位区分
如果要对高低肛瘘作个严格的区别，只需从病灶上来认识便可。病灶也就是瘘管，在瘘管形成之初，其数量一般只有一个，被称为主灶。随着病情的不断发展，可能会出现多个小瘘管，被称为支管。主灶的构成形态有两种，其一是管道颇长，内口较深，迁延范围很广，其二是管道颇短，内口较浅，迁延范围有限。肛瘘瘘管开口肛门外括约肌深部以上为高位肛瘘，肛门外括约肌深部以下肛瘘属于低位肛瘘。
二、共同表现
1、排脓：排脓是其主要症状。一般来说，新生成的瘘管排脓较多，脓汁粘稠，黄色、味臭;瘘管日久的排脓相对较少，或时有时无，稀淡如水;若脓量增加，则表示新瘘管生成。瘘管有时会暂时封闭，不排脓液，从而出现局部肿痛，体温上升，以后封闭的瘘口破溃，又排出脓液，也可从瘘口排出气体或粪便。
2、疼痛：瘘管通畅无炎症时，一般无疼痛，只有肛门局部略有肿胀感，行走时可加重，若外口封闭，瘘管存积脓液，或粪便进入瘘管，则会疼痛加重或排粪时疼痛加重，而内盲瘘则常感直肠下部和肛门部灼热不适，排粪时疼痛加重。
3、瘙痒：肛门部皮肤由于脓液及其他排出物刺激，常感觉皮肤瘙痒。
4、硬结或瘢痕：由于瘘管壁及瘘口的反复刺激，使纤维组织增生，在管壁和瘘口形成质韧的结缔组织，常表现为瘘管周围皮肤变色，表皮脱落，凹陷变形，触及条索状硬结通向肛门内。
5、全身症状：多数无全身症状;当肛瘘侵犯范围较大较深或支管较多时，反复炎症感染，会导致消瘦、贫血、便秘、排便困难等全身症状。