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三种淋巴丝虫病鉴别除依据流行区居住史及临床表现外，主要依靠病原形态学和免疫学方法。丝虫病急性期的淋巴管炎与淋巴结炎应与细菌性淋巴管炎等鉴别。细菌性淋巴管是自下而上向局部淋巴结发展，一般可找到局部病灶，且中毒症状较重，局部疼痛和压痛也较显著，血液中性粒细胞明显增高。
精索炎与附睾炎应与附睾结核区别。结核病史可供参考，附睾结核呈结节状肿大，质硬，轻压痛。必要时可做活组织检查。
腹股沟或股部淋巴结曲张应与疝气鉴别。可根据淋巴管曲张，叩诊无空音，无肠鸣音亢进，大小随体位改变较少，咳嗽时冲动不存在，穿刺时可得淋巴液及在淋巴液内可找到微丝蚴等鉴别。
精索淋巴管曲张与精索静脉曲张不易区分，后者管壁较厚，管形较清楚，必要时可从管内抽液检查，以资鉴别。
乳糜尿虽多见于丝虫病，但应与结核、肿瘤、胸导管受压或损伤等所引起者加以鉴别。
象皮肿亦可见于反复性细菌性淋巴管炎之后，或因局部损伤、肿瘤压迫而使淋巴回流受阻，手术切除淋巴组织后也可引起，此时应结合病史鉴别。此外，尚需与先天性或家族性象皮肿鉴别。在浙江非丝虫病流行区，曾发现一家四代有14人呈现遗传性象皮肿者。