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潜伏期1～30天，平均14～18天。
起病常常在已愈的原咬伤处又出现疼痛，肿胀发绀以至坏死，可形成水疱，其上覆以黑痂，下面逐渐形成硬结下疳样溃疡。局部淋巴结肿大，有压痛，常伴有淋巴管炎。同时有寒战高热，体温可迅速上升达40℃以上。在体温上升时伴有头痛，全身乏力、肌痛、关节痛。尽管关节疼痛，但无关节腔渗液。严重者可有呕吐、腹泻、便血和中枢神经系统症状，如谵妄、昏迷、颈强直等全身中毒症状。约50%患者出现皮疹，典型出疹多由咬伤处开始，而后波及四肢及躯干。面部及掌跖处较少。皮疹形态多异，多为暗红色或紫色的斑丘疹，呈椭圆形，边界清楚，基底较硬，不痛不痒可融合至数厘米大小。偶有玫瑰疹或荨麻疹。经3～5天后，随体温下降，症状消失，皮疹隐退。间隔3～7天后，体温又复上升，上述症状及皮疹再现。如不经治疗可反复发作持续3～8周，极少数患者可反复发作达1年以上。大多数经多次反复发作后，症状逐渐变轻，热型也不规则，以至诊断困难。
未经治疗其病死率达6%左右。由于长期发作，常合并有其他并发症，如心内膜炎、脑膜炎、心肌炎、肝炎和肾小球肾炎、贫血、附睾炎、胸膜渗出和脾肿大。自抗生素应用以来，迁延不愈者已不多见，病死率下降，并发症也随之减少。
临床诊断主要依据鼠咬史及其特有的临床症状，如回归热型高热，局部硬结性溃疡，淋巴结炎，淋巴管炎以及皮疹。确诊还有待动物接种找到病原菌。