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1.Behcet病嗜人T淋巴细胞病毒Ⅰ型相关性葡萄膜炎和Behcet病都可表现为弥漫性视网膜血管炎，但前者所致的视网膜血管炎较轻，很少伴有视网膜出血和渗出，不会有前房积脓。而后者有全身改变如口腔和生殖器溃疡、皮肤改变等。
2.弓形虫病嗜人T淋巴细胞病毒Ⅰ型相关性葡萄膜炎不会引起视网膜坏死，以此可以与引起视网膜坏死的弓形虫病等鉴别。
3.结节病嗜人T淋巴细胞病毒Ⅰ型相关性葡萄膜炎和结节病均可引起肉芽肿性葡萄膜炎，但后者可有胸部X线异常，血清血管紧张素转化酶水平升高，而前者没有。
4.嗜人T淋巴细胞病毒Ⅰ型相关性葡萄膜炎与Vogt-小柳原田综合征、结核、梅毒或风湿病的鉴别可依据各自不同的全身改变鉴别。