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(一)发病原因
肠道病毒均属微小核糖核酸(RNA)型病毒，直径20～30nm呈球形，居于人类肠道内，对一般理化因素的抵抗力强。根据感染动物病理变化不同，柯萨奇病毒可分A、B两组，A组有24个型，可引起乳鼠骨骼肌广泛的炎变和坏死，出现弛缓性瘫痪而不侵犯中枢神经系统。B组有6个型，可使乳鼠发生局限性肌炎、脂肪组织坏死、脑脊髓炎，肝及胰脏局灶性病变。埃可病毒共34个型，其中8，10，28，34型已归入其他病毒组。如10型列入呼吸道肠道病毒或呼肠孤儿病毒第Ⅰ型，埃可8型与Ⅰ型抗原相同，统称为Ⅰ型。28型不耐酸，有别于其他肠道病毒，而划入鼻病毒类。34型看作柯萨奇病毒A组24型的一个抗原变种。除9型病毒可使乳鼠致病外，其他各型不感染乳鼠，此点与柯萨奇病毒不同。但对人肾和猴肾细胞敏感，故用来分离病毒。近年来，世界各地不断发现有与埃可和柯萨奇病毒抗原性不同的新肠道病毒68～71型。
(二)发病机制
埃可和柯萨奇病毒经呼吸道或口腔进入消化道，侵入肠道黏膜，在该处的上皮细胞及肠壁淋巴组织中居留和增殖。在早期也可在咽部淋巴组织停留和增殖，时间较短。病毒可从上述部位经淋巴及血液循环到达全身各器官，引起内脏器官病变，较易侵犯者有神经系统、皮肤、黏膜、肌肉、肺、心和肝，出现不同的病理改变。如脑部局灶性细胞浸润伴退行性变，心脏间质性心肌炎、局灶性坏死、心包炎，肝脏局灶性细胞浸润。柯萨奇B组病毒感染新生儿时，可引起广泛病变，出现灶性坏死，病情严重。