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老年人的慢性肾盂肾炎临床表现多不典型，常复杂多样。重者急性发病时可表现为与急性肾盂肾炎相似的症候群。可有明显的全身感染症状。较常见的症状有全身不适、体重减轻、低热、尿失禁、排尿困难、尿潴留、多尿、夜尿等。少数病人表现为腰痛、腹部隐痛或肾绞痛。轻者可无症状，仅有尿液改变。个别病人仅有高血压。有尿流梗阻、留置导尿或神经源性膀胱病人出现慢性菌尿时应怀疑有慢性肾盂肾炎，常见的有下列5型：
1.复发型 常多以急性发作，发病时可有全身感染症状，尿路局部表现及尿液变化等均类似急性肾盂肾炎。
2.低热型 以长期低热为主要表现，可伴乏力、腰酸、食欲不振和体重减轻等。
3.血尿型 可以血尿为主要表现，呈镜下或肉眼血尿，发病时伴腰痛、腰酸和尿路刺激症状。
4.隐匿型 无任何全身或局部症状，仅有尿液变化，尿菌培养可阳性，又称无症状性菌尿。
5.高血压型 在病程中出现高血压，偶可发展为急进性高血压，常伴贫血，但无明显蛋白尿和水肿等。
除上述类型外，少数病例尚可表现为失钠性肾病、失钾性肾病、肾小管性酸中毒和慢性肾功能不全。
老年人肾盂肾炎常存在尿滞留的因素，易引起尿路败血症，应加警惕。Posito等报道100例老年败血症，34%由肾盂肾炎所致，其中仅7例有尿路刺激症状，8例有尿路插管史。Tunn等报道革兰阴性杆菌败血症中，55%来源于尿路感染，尿路败血症易并发休克，病死率甚高。
慢性肾盂肾炎较早期肾浓缩功能障碍而GFR相对保存完好。由于一开始细菌在髓质繁殖，引起广泛的炎症反应，最终出现瘢痕，肾小管结构扭曲，从而干扰髓质转运机制。这些变化可引起多尿、夜尿、肾性尿崩症和电解质穿孔。病变累及皮质，有广泛的瘢痕形成时导致肾衰。
易复发是肾盂肾炎的临床特点，再次发作可以是原病复发或是重新感染，两者性质不同，且处理与预后各异，必须区分。复发是指肾盂肾炎未治愈，只是病情暂时缓解，在某些因素促发下，潜伏的细菌又引起炎症而发病;重新感染则是原病已愈，细菌已灭，由新的致病菌入侵所致。
尿细菌培养结果符合真性细菌尿或肾盂肾炎病程超过半年，伴有下列情况之一者可诊断为慢性肾盂肾炎：影像学检查发现肾盂肾盏变形、缩窄;两肾大小不等，肾表面凹凸不平;肾小管功能有持续性损害。