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本病治疗较困难，因此预防非常重要。应提高机体抵抗力，防止发生枸橼酸杆菌肺炎。要积极治疗原发病；正确掌握抗生素、糖皮质激素使用指征；保持病房内空气新鲜洁净，特别是对于重症监护室、新生儿室、老年病房及其他易感者所住病房。如肿瘤化疗放疗病人，肾移植病人等，要定期用紫外线照射，地板湿擦消毒剂；各种诊断及治疗操作，特别是呼吸治疗仪器应严格无菌消毒制度；及时治疗病人加强护理，防止交叉感染。