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按临床表现分为如下2型。
1.无孔隔膜 见于新生儿，表现为完全性幽门梗阻，生后不久即出现频繁的呕吐，呕吐物不含胆汁，往往有呼吸困难、发绀和流涎过多等现象。患儿出生后可排出少量胎便，但以后都无大便排出。体格检查可发现上腹部膨胀，可见胃中、下腹部平坦或凹陷呈舟状。
2.有孔隔膜 见于儿童和成年人。根据隔膜孔径大小的不同，其梗阻的程度和发病迟早各异。病人多自出生后即有呕吐，呈间歇性发作。呕吐常发生在进食后，呕吐物多未消化，不含胆汁。病人常在进食后出现上腹部饱胀不适或上腹部疼痛等症状，往往在呕吐后症状缓解。病人常因食欲差而有体重不增或体重下降。如梗阻不严重，体格检查多无特殊发现。
胃隔膜的诊断困难。当新生儿有频繁呕吐不含胆汁的胃内容物时，应当考虑此病。无孔的胃隔膜钡剂检查可发现幽门完全梗阻。有孔胃隔膜的临床表现和X线发现与先天性肥厚性幽门狭窄不易鉴别。胃镜检查有助于诊断，可排除X线假阳性结果。