肾痛在早期可没有症状，原发感染灶可能已愈而被忽视，后期出现肾区痛，突然发病，并伴有寒战，高烧、食欲不好等菌血症或毒血症表现，患病的一侧可出现肾区痛、压痛、叩压痛，有时因腰痛影响腿部活动不适，可触及肿大的肾脏，腰部肌肉紧张。
关于肾痛的诊断，有感染灶病史，如上呼吸道感染、疖、脓肿、伤口等。高热，寒战，菌血症的表现、腰痛、腰部压痛、叩击痛、并可摸到肿大的肾脏，辅以尿血检查、B型超声及CT检查可以诊断。
同时进行相关的辅助检查也可帮助患者进行诊断，如血白细胞增多分叶核细胞增多，血液细菌培养可呈阳性；尿内可有脓细胞，尿培养有细菌生长，尿沉渣涂片染色可找到细菌。