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应注意发病年龄和体质因素。呕吐重者容易和中枢神经系统的器质性疾病如脑膜炎、脑肿瘤,以及急腹症相混淆,但神经系统和腹部检查以及钡餐检查皆正常。脑电图检查有时可见癫痫波形,但用抗癫痫药无效。以后随年龄增长至青春期发作渐轻,次数减少渐趋痊愈、个别患儿青春期以后遗留偏头痛。
鉴别诊断方面须与颅内压增高症(颅内感染及肿瘤等)、先天性代谢病如苯丙酮尿症、半乳糖血症及尿素环代谢病(urea cycle disease)也可出现反复呕吐、较大儿童出现再发性呕吐而有不同程度的意识障碍者,须考虑自主神经性癫痫。