如果扁桃体发炎是由病毒引起的，通常不需要使用抗生素治疗，因为抗生素对病毒无效。如果是细菌感染，医生可能会开具抗生素。
扁桃体是人体的第一防御器官，所以幼儿扁桃体发炎是小儿最常见的疾病。儿童扁桃体发炎一般情况下是细菌感染所致，因为扁桃体发炎多见于溶血性链球菌，最好是能口服青霉素类或头孢类的消炎药，可以给宝宝口服阿莫西林颗粒、青霉素V钾颗粒、头孢克肟、头孢克肟颗粒、头孢地尼颗粒、头孢呋辛酯颗粒等。
如果宝宝对青霉素、头孢过敏，则可以口服阿奇霉素颗粒、罗红霉素颗粒治疗，同时可以吃一些清热解毒的中成药，一般是儿童类药物，如小儿咽扁颗粒、射干利咽口服液等，还可以喷开喉剑喷雾剂减轻宝宝的咽喉不适。平时应该给孩子多喝水，吃新鲜富含维生素的蔬菜、水果，有助于疾病的恢复。