宝宝扁桃体发炎大多数是由于链球菌感染引起的，可以吃青霉素类、头孢类或大环内酯类等抗生素，如果伴有发热的情况，可以使用非甾体抗炎药降低体温，还可根据宝宝的具体表现吃一些有消炎镇痛作用的中成药。
宝宝扁桃体发炎可以吃阿莫西林颗粒，属于青霉素类的广谱抗生素，具有消炎止痛的疗效。
部分宝宝对青霉素类的药物过敏时，可以选用头孢类的药物，常用的有头孢氨苄颗粒、头孢呋辛酯颗粒等，主要以消炎杀菌作用为主，同时具有镇痛效果。
如果宝宝对青霉素类药物和头孢类药物都过敏，可以吃大环内酯类的药物，如罗红霉素颗粒进行治疗。
如果宝宝扁桃体发炎伴有高热、头痛以及全身酸痛的情况，可以服用布洛芬缓释混悬液、对乙酰氨基酚混悬液等非甾体抗炎药，进行解热镇痛治疗。
宝宝扁桃体发炎也可以吃一些有消炎镇痛作用的中成药，如蒲地蓝消炎口服液等，对扁桃体发炎有较好的疗效。